一、实验原理
全血DNA提取的核心目标是分离白细胞中的基因组DNA由于成熟红细胞无细胞核,需先裂解红细胞并保留含DNA的白细胞关键原理包括:
抗凝处理:采集时需使用EDTA或肝素抗凝剂防止血液凝固,保护DNA稳定性
红细胞裂解:通过低渗溶液选择性裂解红细胞,保留白细胞沉淀
白细胞裂解与去蛋白:用SDS(十二烷基硫酸钠)或蛋白酶K破坏细胞核膜,释放DNA,并通过有机溶剂(酚/氯仿)或盐析法去除蛋白质杂质
DNA沉淀纯化:乙醇或异丙醇沉淀DNA,去除盐分和残留溶剂
二、标准实验步骤
1.样本采集与预处理
采集5-10ml静脉血至EDTA抗凝管,4℃保存避免DNA降解
关键点:肝素抗凝可能抑制后续PCR反应,推荐EDTA抗凝
2.红细胞裂解
加入3-5倍体积红细胞裂解液(如0.1M NH₄Cl或商品化RLB液),轻柔混匀后冰浴10分钟
离心(1500-2000g,10分钟),弃红色上清,保留白色白细胞沉淀
3.白细胞裂解与DNA释放
方法一(蛋白酶K消化):
沉淀中加入核裂解液(含SDS、Tris-HCl、EDTA)和蛋白酶K(终浓度100μg/ml),55-65℃孵育3-4小时或过夜
方法二(盐析法):
加入饱和NaCl溶液(6M),剧烈振荡后离心沉淀蛋白质,上清液含DNA
4.DNA纯化
有机溶剂法:
裂解液与酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)混合,离心后取上层水相
试剂盒法(主流方法):
裂解液转移至硅胶膜吸附柱,离心去除杂质,再用70%乙醇洗涤
5.DNA沉淀与溶解
水相加等体积异丙醇或2倍体积冷乙醇,轻柔颠倒混匀至DNA絮状析出
离心收集DNA沉淀,70%乙醇洗涤后干燥,溶于TE缓冲液(pH 8.0)或超纯水
三、质量控制与常见问题
1.质量检测
纯度:分光光度计检测OD260/OD280比值(1.8-2.0为佳),比值<1.8提示蛋白质污染
浓度:理想范围50-100ng/μL
完整性:琼脂糖凝胶电泳,清晰条带无拖尾表明无降解
2.常见问题与优化
问题原因解决方案
DNA产量低红细胞裂解不彻底增加裂解液体积或延长裂解时间
蛋白质污染酚/氯仿抽提不充分重复抽提或改用盐析法
DNA降解样本保存不当或操作剧烈全程低温操作,避免剧烈振荡
PCR抑制肝素残留或乙醇未除净改用EDTA抗凝,延长干燥时间
四、技术对比与选择建议
方法优点缺点适用场景
有机溶剂法成本低,DNA完整性好有毒试剂,操作复杂科研实验室
盐析法安全快速,无需有毒试剂DNA纯度略低大规模临床检测
试剂盒法操作简便,30-40分钟完成成本较高常规诊断与高通量实验
注:试剂盒法(如天根DP349、QuickGene)已逐步成为主流,尤其适合临床和小样本
五、应用领域
提取的DNA可用于:
遗传病诊断:如地中海贫血基因检测
法医学:STR分型用于亲子鉴定
感染病研究:病原体DNA检测
肿瘤标志物分析:循环肿瘤DNA研究
六、未来发展方向
自动化提取:整合微流控技术实现全流程自动化
免提直接扩增:开发直接PCR血液样本技术,省略提取步骤
通过标准化操作和质控,全血DNA提取已成为分子生物学和精准医疗的基石技术