1.变性(Denaturation)
温度与作用:在高温(通常为94–95°C)下,双链DNA的氢键断裂,两条互补链解离为单链,形成后续反应的模板。
时间与细节:首次变性需较长时间(如1–5分钟),确保模板完全解链;后续循环中,变性时间缩短至20–30秒。这一步骤的关键在于破坏DNA的二级结构,避免残留双链影响引物结合。
2.退火(Annealing)
温度与作用:温度降至50–65°C(通常55°C左右),引物与模板DNA单链的互补区域特异性结合。引物的设计需与目标序列两端匹配,确保扩增的特异性。
影响因素:退火温度取决于引物的Tm值(熔解温度)。温度过高会导致引物无法结合,过低则可能引发非特异性结合。例如,
提到“温度需降至引物Tm值以下”,而指出退火温度常设为55°C。
3.延伸(Extension)
温度与作用:在72°C下,耐热DNA聚合酶(如Taq酶)以dNTP为原料,沿模板从引物3'端开始合成新链。
时间与效率:延伸时间由目标片段长度决定,一般按1分钟/kb计算。例如,扩增1kb片段需1分钟,而
提到“每1kb增加30–60秒”。此阶段完成后,DNA拷贝数翻倍。
循环与指数扩增
PCR通过重复上述三步循环(通常20–40次),使目标DNA呈指数增长。例如:
第1–2个循环:仅生成长链DNA,无短目标片段。
第3个循环后:短目标片段开始出现,并逐渐占据主导。
30个循环后:DNA可扩增至10亿倍(理论上为
倍)。
关键组分与优化
引物设计:需避免发夹结构或二聚体,长度通常18–25bp。
酶的选择:热稳定性是核心,如Taq酶可耐受高温变性步骤。
温度控制:热循环仪需精确调控温度和时间,避免非特异性产物。
应用与意义
PCR技术广泛应用于基因克隆、疾病诊断(如核酸检测)、法医学鉴定等领域。其高效性和特异性使其成为分子生物学的基石技术,例如在COVID-19检测中,RT-PCR(结合逆转录步骤)用于病毒RNA的快速筛查。
通过理解这三个核心步骤,我们可以更深入地掌握PCR的原理,并针对不同实验需求优化条件,从而推动科研与医疗的进步。