DNA提取试剂盒:各试剂的作用与原理
DNA提取是分子生物学的基础操作,试剂盒通过优化试剂组合实现高效、纯净的核酸分离不同样本(血液、土壤、粪便等)需专用试剂盒,但核心试剂作用相似,主要分为裂解、结合、洗涤、洗脱四个阶段,各试剂协同完成DNA纯化
一、裂解阶段:破坏细胞结构释放DNA
裂解缓冲液(Lysis Buffer)
含离液盐(Chaotropes)(如盐酸胍、硫氰酸胍):破坏细胞膜的氢键和疏水作用,使蛋白质变性
SDS(十二烷基硫酸钠):离子型表面活性剂,溶解细胞膜脂质蛋白复合物,促进DNA与蛋白质分离
蛋白酶K(Proteinase K):降解样本中的蛋白质(如组织胶原、血红细胞),减少杂质干扰
辅助试剂
EDTA(乙二胺四乙酸):螯合Mg²⁺、Ca²⁺等金属离子,抑制DNA酶(DNase)活性,防止DNA降解
Tris-HCl:维持体系pH稳定(通常pH 8.0),保障后续反应效率
巯基乙醇:抗氧化剂,防止酚类氧化成醌(会损伤DNA),兼具消泡作用
特殊样本适配:
土壤/粪便样本:需强化裂解(如锆珠机械破碎)并添加去除腐殖酸试剂,避免抑制物污染
全血样本:裂解液中需加入NaCl降低DNA溶解度,凝聚蛋白杂质
二、结合阶段:DNA特异性吸附
结合缓冲液(Binding Buffer)
含高浓度盐(如醋酸钠、醋酸钾):中和SDS电荷,使DNA与吸附材料(硅胶膜、磁珠)结合
溶液III(醋酸钾缓冲液):将pH从碱性(12.6)回调至中性,促使染色体DNA、RNA及SDS-蛋白复合物共沉淀
吸附材料
硅胶膜/磁珠:在高盐条件下通过氢键或静电作用特异性吸附DNA,弃去液体杂质
注:磁珠法优势
磁珠表面修饰官能团,可高效结合DNA,适用于自动化提取(如Thermo KingFisher仪器)
三、洗涤阶段:去除残留杂质
洗涤缓冲液(Wash Buffer)
Buffer WA/WB:含乙醇或异丙醇,去除盐离子、残留蛋白质及代谢物
Buffer CFD3/Buffer WB2:低盐溶液进一步清除抑制剂(如腐殖酸、肝素)
关键操作:多次离心或磁分离,确保洗涤彻底,避免下游PCR抑制
四、洗脱阶段:DNA溶解回收
洗脱液(Elution Buffer):
常用TE缓冲液(Tris-EDTA)或无菌水,低离子强度环境使DNA从吸附材料释放
洗脱体积影响浓度:小体积(如50μL)可提高浓度,但可能降低得率
试剂盒选择与注意事项
样本类型决定试剂盒:
血液:需高效裂解红细胞(如Buffer MG-A)
环境样本(水/土壤):需强化抑制剂去除(如腐殖酸吸附柱)
游离DNA(血浆/尿液):需高灵敏度磁珠富集片段
试剂盒差异影响结果:
不同试剂盒提取的DNA浓度、纯度及微生物组成(如16S测序)存在显著差异,研究需统一方法
例如:QIAamp®DNA Micro试剂盒在多数样本中得率较高,而PowerSoil®Pro更适土壤
存储与操作:
蛋白酶K、RNase A需-20℃保存,裂解液避光
防止外源DNA酶污染(操作台清洁、戴手套)
结语
DNA提取试剂盒通过化学与物理作用的精密配合,实现“破壁→捕获→净化→释放”的全流程理解各试剂作用有助于优化实验设计,提升下游应用(如PCR、测序)的准确性与可重复性未来随着纳米材料与自动化技术的发展,试剂盒将向更高通量、更广适用性方向演进